In cadrul Spitalului Clinic Judetean Mures functioneaza trei farmacii, respectiv Farmacia nr. 1, nr. 2 si nr. 3, care deservesc un nr. de 1119 paturi distribuite in 23 sectii, majoritatea clinici.

Farmacia nr. 1 deserveste cu medicamente si materiale sanitare urmatoarele sectii:

• Medicina interna
• Gastroenterologie
• ATI
• Nefrologie
• Urologie
• Pneumologie
• Endocrinologie
• Psihiatrie I
• Psihiatrie II
• Pediatrie
• Oncologie
• Ortopedie si traumatologie
• Laboratoare

Farmacia nr. 2 deserveste cu medicamente si materiale sanitare urmatoarele sectii:

• Dermato-venerologie
• Obstetrica-Ginecologie
• Oftalmologie
• Neonatologie prematuri
• Neuropsihiatrie pediatrica
• Medicina Muncii

Farmacia nr. 3 deserveste cu medicamente si materiale sanitare urmatoarele sectii:

• Boli Infectioase I
• Boli Infectioase II
• Laboratorul de analize medicale
• Preventoriul TBC

Colectivul Farmaciei nr. 1 este alcatuit din:

• 3 farmacisti primari
• 15 asistenti principali
• 1 registrator
• 1 ingrijitor

Farmacia nr. 1 este coordonata de Farm. Primar Sef Blaj Minodora

Colectivul Farmaciei nr. 2 este alcatuit din:

• 2 farmacisti primari
• 9 asistenti principali
• 1 registrator
• 1 ingrijitor

Farmacia nr. 2 este coordonata de Farm. Primar Sef Nagy Emoke

Colectivul Farmaciei nr. 3 este alcatuit din:

• 1 farmacist primar
• 4 asistenti principali
• 1 registrator

Farmacia nr. 3 este coordonata de Farm. Primar Sef Taurean Alexandra

Personalul farmaciilor este calificat, cu multă experienţă şi în continuă perfecţionare profesională. Farmaciile  funcţionează în conformitate cu legislaţia în vigoare privind securitatea în muncă cu respectarea codului de deontologie medicală si a Regulilor de Buna Practica Farmaceutica.
In cadrul farmaciilor functioneaza urmatoarele compartimente: oficina, laboratoare, depozite de medicamente , solutii perfuzabile si materiale sanitare.
Principala activitate a farmaciilor este asigurarea aprovizionarii continue cu medicamente si materiale sanitare a tuturor sectiilor Spitalului Clinic Judetean Mures.